Se trabaja en cooperación técnica con los Programas Nacionales de Control de la Enfermedad de Chagas, individualmente, y en Iniciativas Subregionales de Control de la Enfermedad de Chagas, que se basan en la asociación internacional de esfuerzos y en la cooperación técnica horizontal. Son cinco estos Proyectos Subregionales:  

• Cono Sur (Argentina, Bolivia, Brasil, Chile, Paraguay y Uruguay)

• Centroamérica (Panamá, Costa Rica, Nicaragua, Honduras, El Salvador, Guatemala y  Belice)

• Andina (Perú, Ecuador, Colombia y Venezuela)

• Amazonia (Bolivia, Brasil, Perú, Ecuador, Colombia, Venezuela, Guyana, Guayana  Francesa, Surinam)

• México

Múltiples objetivos y logros, han logrado estos esfuerzos subregionales de integración en el control de Chagas, que han llevado a OMS a postular la interrupción de la transmisión de Chagas para el año 2010